Un estudio proteogenómico ha revelado cómo las variantes genéticas heredadas, conocidas como variantes de la línea germinal, desempeñan un papel fundamental en la progresión del cáncer

En 2022, el Consorcio de Análisis Clínico Proteómico de Tumores (CPTAC en sus siglas en inglés) investigó las células cancerosas, caracterizadas por sufrir grandes alteraciones, y explicó cómo las mutaciones en el ADN se traducen en proteínas alteradas, que son las responsables del comportamiento anómalo de esas células cancerosas. Ahora, el mismo consorcio ha hallado, a través de un estudio proteogenómico, pruebas de que muchos pacientes con cáncer heredaron de sus progenitores estas variantes genéticas que modifican proteínas.

El estudio, publicado recientemente en la prestigiosa revista Cell, explora los efectos de las variantes de la línea germinal en proteomas de pacientes con cáncer, es decir, el conjunto completo de proteínas expresadas en sus células. Con datos de más de 1.000 pacientes y de 10 tipos diferentes de cáncer, esta investigación es una de las más exhaustivas realizadas hasta la fecha sobre la relación entre las mutaciones genéticas heredadas y los mecanismos moleculares que impulsan el cáncer. Kathleen J. Imbach y el Dr. Eduard Porta, miembros del grupo de Inmunogenómica del Cáncer en el Instituto de Investigación contra la Leucemia Josep Carreras, firman la publicación como coautora principal y cosupervisor sénior, respectivamente.

El estudio aprovecha los amplios conjuntos de datos generados por el CPTAC, que incluyen información genómica, transcriptómica, proteómica, acetilómica y fosfoproteómica, para evaluar el impacto de más de 337.000 variantes de la línea germinal en la expresión y función de las proteínas. El equipo identificó 119 variantes de la línea germinal, tanto raras como comunes, en genes clave del cáncer que alteran la estructura y abundancia de las proteínas. Se descubrió que estas variantes afectan procesos críticos en el desarrollo del cáncer, como la estabilidad de las proteínas, las modificaciones postraduccionales y la señalización celular.

Hallazgos del estudio proteogenómico

Estos hallazgos subrayan la importancia de las variantes de la línea germinal no solo en el aumento del riesgo de cáncer, sino también en la configuración de la biología del propio tumor. La integración de datos proteómicos y genómicos permitió al equipo de investigación mapear estas mutaciones hereditarias directamente en los datos proteicos específicos de cada paciente, lo que les permitió entender mejor cómo estas variantes contribuyen al desarrollo y la progresión tumoral.

Este es uno de los puntos clave de la nueva investigación, ya que el enfoque proteogenómico, o «peptidómica de precisión», según los autores y las autoras, les permitió ir más allá del puro análisis de asociación y comprender realmente cómo muchas variantes genéticas diferentes, que no son dañinas por sí solas, pueden acabar teniendo un impacto significativo en el riesgo de sufrir cáncer. Al detallar cómo estos factores genéticos influyen en el comportamiento de las proteínas, el estudio abre nuevas vías para el desarrollo de terapias personalizadas contra el cáncer y estrategias de prevención.